Excel consente di proteggere sia le cartelle (cioè i file), sia i fogli.

Per quanto riguarda le Cartelle, è possibile proteggere il file sia prima che dopo l'apertura.

Per proteggere il file ancora prima che esso venga aperto, è possibile inserire una password di apertura (il file si apre solo se si inserisce la password) e di scrittura (gli utenti possono sia aprire che apportare modifiche). Entrambe le opzioni lavorano su uno specifico file (di solito in rete): chiuque entri, con qualunque privilegio, può fare in ogni momento una copia del e apportare tutte le modifiche che vuole. Per fare tutto bisogna entrare nel menu File (con Excel 2007 > Pulsante Office), scegliere Salva con nome e premere il pulsante Opzioni generali impostando le password desiderate e confermandole.

Se si desidera proteggere il file dopo la sua apertura, è possibile lavorare sul menu Proteggi cartella di lavoro del menu Strumenti > Protezione (in Excel 2007 > si trova nella scheda Revisione, gruppo Revisioni). Scegliendo di proteggere la Struttura l'utente aprirà il file, ma non potrà cancellare, nascondere, scoprire o aggiungere fogli; proteggendo le Finestre l'utente non potrà modificare la dimensione delle finestre che appariranno.

Per la protezione dei fogli si veda il tip Speciale Sicurezza - 2